Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TM4SF18Q96CE8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TM4SF18Q96CE8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms