Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDF1Q96CC6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.2 ms