Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2E3Q969T4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms