Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms