Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCAMP4Q969E2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms