Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms