Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIPC3Q8TF64 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GIPC3Q8TF64 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms