Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIEQ8NEW7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms