Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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ZNF439Q8NDP4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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