Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TTC29Q8NA56 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TTC29Q8NA56 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TTC29Q8NA56 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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TTC29Q8NA56 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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