Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms