Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RASSF3Q86WH2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RASSF3Q86WH2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms