Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
HRCT1Q6UXD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms