Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPPQ6IPU0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms