Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E7

TXNRD3NB, Protein TXNRD3NB, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3NBQ6F5E7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNRD3NBQ6F5E7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms