Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATL3Q6DD88 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms