Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1177.2 ms