Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PROX2Q3B8N5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms