Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RRN3P1Q2M238 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms