Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KNOP1Q1ED39 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KNOP1Q1ED39 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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