Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GEN1Q17RS7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GEN1Q17RS7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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