Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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