Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SYPL1Q16563 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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