Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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