Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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VPS72Q15906 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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