Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRADDQ15628 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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