Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CDSNQ15517 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms