Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SIX1Q15475 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SIX1Q15475 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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SIX1Q15475 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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