Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms