Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PTPRRQ15256 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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