Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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