Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAPQ14761 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAPQ14761 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms