Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT33BQ14525 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms