Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms