Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL4A6Q14031 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL4A6Q14031 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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