Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL4BQ13620 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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