Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CUL2Q13617 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL2Q13617 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms