Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CUL1Q13616 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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