Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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