Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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