Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CBX3Q13185 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CBX3Q13185 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CBX3Q13185 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CBX3Q13185 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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