Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RPA4Q13156 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPA4Q13156 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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