Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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GPS1Q13098 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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GPS1Q13098 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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GPS1Q13098 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPS1Q13098 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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