Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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