Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP3Q12983 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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