Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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