Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CNTN1Q12860 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CNTN1Q12860 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNTN1Q12860 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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