Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFCP2Q12800 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFCP2Q12800 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TFCP2Q12800 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TFCP2Q12800 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms