Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNMA1Q12791 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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