Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A7Q0GE19 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms